1 unit (U) Taq Platinum DNA Polymerase zochita zimatanthauzidwa kuti kuchuluka kwa ma enzyme omwe amafunika kuphatikizira 10 nmol deoxynucleotides muzinthu zosasungunuka acid pa 74 ° C mkati mwa 30 min pogwiritsa ntchito umuna wa salmon wa DNA monga template / primer.
Chiyero chodziwika ndi SDS-PAGE ndi choposa 99%; Palibe zochitika zakunja kwa nuclease zomwe zapezeka; Mtundu wamtundu umodzi wamtundu wamunthu ukhoza kukulitsidwa bwino; Palibe kusintha kwakukulu pazochitika zikasungidwa kutentha kwa sabata imodzi.
Ili ndi zochitika za 5'-3 'zakhululukidwe komanso 3'-5' ntchito zowakhululukira, ndipo kudalirika kwake kuli pafupi ndi Pfu polymerase. Liwiro lokulitsa la Taq Platinum Polymerase ndilothamanga kuposa Pfu polymerase ndipo kukweza kwake ndikokwera. Zogulitsa za PCR zimatha kulumikizidwa mwachindunji kumapeto kopindika kapena kupangidwa ndi vekitala wa TA. Ngati ntchito yolumikizira ikufunika kukonzedwa, tikulimbikitsidwa kuyeretsa koyamba ndikuwonjezera ma 3'-dA overhangs musanalowe mu vekitala wa TA.
Tubu imodzi Taq Platinum MasterMix (National High-Tech Product Certification)
■ Taq Platinum MasterMix yakwaniritsa kusintha kwakanthawi komanso kuzindikira kwamachitidwe a PCR ndipo imatha kukweza ma tempuleti ovuta okhala ndi GC, kapangidwe kachiwiri ndi zina zotero. Makope awiri a template yomwe mukufuna kutsatirayo itha kukulitsidwa, kutsimikizira zotsatira zoyeserera zolondola.
■ Njira yapadera ya Taq Platinum MasterMix imapangitsa kuti magwiridwe antchito onse akhale okhazikika, ndipo zochitikazo sizingakhudzidwe ndi kuzizira mobwerezabwereza kapena kusungitsa kwakanthawi kwa 4 ° C.
■ Kukhazikika kosasunthika komanso koyenera kwa PCR kosakanikirana kumatha kupangitsa kuti ntchitoyi ichitike mwachangu komanso mophweka, kumachepetsa kwambiri kuchuluka kwa ntchito ndi zolakwika zazitsanzo. Mawonekedwe apamwamba a PCR opititsira patsogolo komanso ophatikizira amaphatikizidwanso mu kusakanikirana, komwe kumachepetsa zofunikira pamikhalidwe ya PCR.
■ Chogulitsachi chili ndimakina okhala ndi utoto komanso opanda utoto. Zotengera za MasterMix zodaya zimatha kusankhidwa mwachindunji pambuyo pa PCR, osawonjezera chosungira.
Itha kusintha Pfu polymerase kuti ikulitse kukhulupirika kwakukulu kuchokera kuma templates ovuta monga ma genomes, ndipo ndioyenera kugwiritsa ntchito monga kupangika kwa majeremusi ofotokozera, kusintha kwa masamba ndi kusanthula kwa single nucleotide polymorphism (SNP), ndi zina zambiri.
Chenjezo pakupanga PCR Primers:
Kutalika koyambira nthawi zambiri kumakhala 20-25 mer. Komabe, pochita PCR yaying'ono, kutalika kwake kuyenera kukulitsidwa mpaka 30-35 mer.
Palibe kulumikizana kophatikizana pakati pazoyambira ziwiri, makamaka pazitsulo zitatu zomaliza kumapeto kwa 3 ′.
■ Zolemba za GC ziyenera kukhala 50-60%, ndikupewa GC yolemera kapena AT. Pofuna kupanga choyambirira ndi template yolimba, pewani mawonekedwe a AT kumapeto kwa 3 '.
■ Pewani choyambira kuti mupange dongosolo lachiwiri.
■ Sankhani mapulogalamu awiri okhala ndi kutentha kwa Tm pafupi.
Kuwerengetsa Mtengo wa Tm wa Primers wa PCR:
■ Zoyambira zikachepera 20 mer: Tm = 2 ° C × (A + T) + 4 ° C × (G + C).
■ Zoyambira zikapitilira 20 mer: Tm = 81.5 + 0.41 × (GC%) - 600 / L, pomwe L ndiye kutalika kwa zoyambira.
■ Khazikitsani kutentha kokwanira (Tm-5) ° C.
Makina omaliza oyambira amatha kusankhidwa pakati pa 0.1 μM ndi 1.0 μM. Kutsika kocheperako kumapangitsa kuti pakhale zokolola zochepa zamagetsi, pomwe kukokomeza kwakukulu kumakhala kosavuta kwenikweni. Nthawi zambiri, kuchuluka kwa template ya DNA kumakhala kokulirapo kapena kovuta DNA (monga DNA yamunthu) imagwiritsidwa ntchito ngati template, koyambira kumakhala kotsika. Kuchuluka kwa template ya DNA ndi yaying'ono kapena yosavuta template ya DNA (mwachitsanzo, plasmid DNA, ndi zina zambiri) imagwiritsidwa ntchito ngati template, koyambira kumakhala koyenera.
Zogulitsa zonse zimatha kusinthidwa kukhala ODM / OEM. Zambiri,chonde dinani Makonda Service (ODM / OEM)
Gwiritsani ntchito genomic DNA ngati template kuti mukweze chidutswa cha 1 kb. Pambuyo pa PCR, tengani 5 μl kuti muzindikire electrophoresis. |
Chizindikiro cha A-1
■ Chikhazikitsochi chimakhala ndi zonyansa zomanga thupi kapena Taq inhibitors, ndi zina zambiri. —— Yembekezerani template ya DNA, chotsani zonyansa zamapuloteni kapena chotsani template ya DNA yokhala ndi zida zoyeretsera.
■ Kutengera kwa template sikokwanira ——Kuchulukitsa kutentha kwa chiwonetsero ndikuchulukitsa nthawi yachinyengo.
■ Kuwonongeka kwa ma template - -Konzani templateyo.
Choyamba cha A-2
■ Zoyambira zoyipa - - Re-synthesize the primer.
■ Kuwonongeka koyambirira ——Gwiritsani ntchito zoyambira zazing'ono kwambiri kuti zikhale zocheperako kuti zisungidwe. Pewani kuzizira kangapo kapena kusungunuka kapena kutalika kwa 4 ° C kosungidwa.
Kupanga koyambira koyenera (mwachitsanzo kutalika koyambirira sikokwanira, kupendekera komwe kumapangidwa pakati pazoyambira, ndi zina zambiri) -Konzani zoyambira (pewani kapangidwe kazoyambira ndi kapangidwe kake)
A-3 Mg2+ndende
■ Mg2+ ndende ndiyotsika kwambiri -—Kuchulukitsa moyenera Mg2+ ndende: Konzani Mg2+ kusakanikirana ndi zochitika zingapo kuchokera 1 mM mpaka 3 mM pakadutsa 0.5 mm kuti adziwe Mg woyenera2+ ndende iliyonse ya template ndi choyambira.
A-4 Kutentha kwa Annealing
■ Kutentha kokulumikiza kwakukulu kumakhudza kumangiriza koyambirira ndi template. —Chepetsani kutentha komwe kumakulitsa ndikuwonjezera vutoli ndi gradient ya 2 ° C.
Nthawi yowonjezera-A-5
■ Kuonjezera nthawi yayifupi —— Wonjezerani nthawi yowonjezera.
Phenomena: Zoyipa zoyeserera zikuwonetsanso magulu omwe akutsata.
A-1 Kuwonongeka kwa PCR
■ Kuwonongeka kwapakati pazinthu zomwe zikulondoleredwa kapena zopititsa patsogolo -—Mosamala kuti musapopetse sampuli yomwe ili ndi cholowa munjira yoyipa kapena kuwataya kunja kwa chubu cha centrifuge. Ma reagents kapena zida ziziyendetsedwa ndi autoclaved kuti zithetse ma nucleic acid omwe alipo, ndipo kupezeka kwa kuipitsidwa kuyenera kutsimikizika kudzera pakuyesa kosayenerera koyeserera.
■ Kuwonongeka kwa reagent ——Pezani mankhwala osungunula ndi kusunga pa kutentha kochepa.
A-2 Yaikulur
■ Mg2+ ndende ndiyotsika kwambiri -—Kuchulukitsa moyenera Mg2+ ndende: Konzani Mg2+ kusakanikirana ndi zochitika zingapo kuchokera 1 mM mpaka 3 mM pakadutsa 0.5 mm kuti adziwe Mg woyenera2+ ndende iliyonse ya template ndi choyambira.
■ Mapangidwe oyambira osayenera, ndipo kutsata kwake kumayanjana ndi maphunziro aumwini osagwirizana ndi cholinga chake. ——Zipangitseni zojambula zoyambirira.
Phenomena: Magulu owonjezera a PCR sagwirizana ndi kukula komwe kumayembekezereka, kaya yayikulu kapena yaying'ono, kapena nthawi zina magulu amakulitsidwe ndi magulu osakondera omwe amapezeka.
Chiyambi cha A-1
■ Kusazindikira koyambirira
——Konzaninso choyambirira.
■ Kutengera koyambira kumakhala kochuluka kwambiri ——Kuchulukitsa moyenera kutentha kwa chiwonetsero chazitali ndikutalikitsa nthawi yakusintha.
A-2 Mg2+ ndende
■ Mg2+ ndende ndiyokwera kwambiri ——Kuchepetsa moyenera ndende ya Mg2 +: Konzani Mg2+ kusakanikirana ndi zochitika zingapo kuchokera 1 mM mpaka 3 mM pakadutsa 0.5 mm kuti adziwe Mg woyenera2+ ndende iliyonse ya template ndi choyambira.
A-3 Thermostable polymerase
■ Kuchuluka kwa ma enzyme —— Chepetsani kuchuluka kwa ma enzyme moyenera pakadutsa 0.5 U.
A-4 Kutentha kwa Annealing
■ Kutentha kokulumikiza ndikotsika kwambiri ——
Zozungulira A-5 PCR
■ Zozungulira za PCR zochulukirapo —— Chepetsani kuchuluka kwamachitidwe a PCR.
Chiyambi cha A-1——Kusalongosoka kwapafupipafupi ——Konzaninso choyambacho, sinthani malo ndi kutalika kwa zoyambira kuti zithandizire; kapena kuchita PCR yokhazikika.
A-2 Chinsinsi DNA
——Tempempheroli sili loyera ——Tsukitsani template kapena tulutsani DNA yokhala ndi zida zoyeretsera.
A-3 Mg2+ ndende
- —Mw2+ ndende ndiyokwera kwambiri ——Chepetsani Mg2+ ndende: Konzani Mg2+ kusakanikirana ndi zochitika zingapo kuchokera 1 mM mpaka 3 mM pakadutsa 0.5 mm kuti adziwe Mg woyenera2+ ndende iliyonse ya template ndi choyambira.
A-4 dNTP
——Kuchuluka kwa ma dNTP ndiokwera kwambiri —— Chepetsani kuchuluka kwa dNTP moyenera
A-5 Kutentha kwa Annealing
——Kutentha kochepa kwambiri koloŵeza ——
Zozungulira A-6
—Zochuluka kwambiri m'zinthu —— Yambitsani kuchuluka kwa kayendedwe kake
Gawo loyamba ndikusankha ma polymerase oyenera. Wokhazikika Taq polymerase sangathe kuwerengera chifukwa chosowa 3'-5 'exonuclease, ndipo kusamvana kumachepetsa kwambiri kukulitsa kwa zidutswa. Chifukwa chake, Taq polymerase wamba sangathe kukulitsa bwino zidutswa zokulirapo zopitilira 5 kb. Taq polymerase yosinthidwa mwapadera kapena kukhulupirika kwakukulu kwa polymerase kuyenera kusankhidwa kuti ikuthandizire kukulitsa zowonjezera ndikukwaniritsa zosowa zamagawo ataliatali. Kuphatikiza apo, kukulitsa kwa zidutswa zazitali kumafunikanso kusintha kofananira kwa kapangidwe koyambira, nthawi yoperekera nthawi, nthawi yowonjezera, pH ya buffer, ndi zina zambiri. Nthawi zambiri, zopangira 18-24 bp zimatha kubweretsa zokolola zabwino. Pofuna kupewa kuwonongeka kwa template, nthawi yodzitchinjiriza yomwe ili pa 94 ° C iyenera kuchepetsedwa kukhala 30 sec kapena kuchepera pakazungulira, ndipo nthawi yokwera kutentha mpaka 94 ° C kukweza kusanachepe 1 min. Kuphatikiza apo, kukhazikitsa kutentha kwazitali pafupifupi 68 ° C ndikupanga nthawi yowonjezera malinga ndi kuchuluka kwa 1 kb / min kumatha kutsimikizira kukulitsa kwa zidutswa zazitali.
Kuchuluka kwa zolakwika za PCR kumatha kuchepetsedwa pogwiritsa ntchito ma polymerases a DNA mosadukiza. Mwa ma Taq DNA polymerases onse omwe apezeka mpaka pano, enzyme ya Pfu ili ndi zolakwika zotsika kwambiri komanso kukhulupirika kwambiri (onani tebulo lolumikizidwa). Kuphatikiza pa kusankha kwa ma enzyme, ofufuza amatha kupititsa patsogolo kusintha kwa kusintha kwa PCR pokonza momwe zinthu zikuyendera, kuphatikiza kukhathamiritsa kophatikizira, kuchuluka kwa ma polymerase osakanikirana ndikukwaniritsa kuchuluka kwa PCR.
Chiyambireni kukhazikitsidwa, fakitole yathu yakhala ikupanga zinthu zoyambirira motsatira mfundoyo
yaubwino woyamba. Zogulitsa zathu zapeza mbiri yabwino pamsika ndikudzidalira pakati pa makasitomala akale ndi akale ..